More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2647 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2647  type II secretion system protein  100 
 
 		 398 aa  795    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29500  putative type II secretion system protein  43.97 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16160  type II secretion system protein  41.94 
 
 		 399 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.996237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3231  type II secretion system protein  38.29 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0387255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  30.15 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  24.55 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  30.75 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  28.75 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  28.89 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  29.18 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  26.95 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 406 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  26.62 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  28.14 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  27.68 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  23.43 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  29.35 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  25.87 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  27.27 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  27.34 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  27.27 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  29.35 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  28.57 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  28.43 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  28.43 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  28.43 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  24.27 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0580  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000819628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  27.68 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  24.69 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  25.44 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  25.44 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 433 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  29.35 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3028  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 403 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000329873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  27.93 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  23.6 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  23 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  27.68 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  27.68 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  24.19 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  23.68 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  24.94 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  22.94 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  26.5 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  23.02 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  28.76 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  28.43 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  27.23 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  26.3 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1048  general secretion pathway protein F  28.14 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  24.63 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  24.63 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  26.72 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  24.63 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  24.63 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  29.21 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  28.76 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  25.56 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1089  general secretion pathway protein F  28.14 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.419193  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  23.69 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  26.62 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  24.51 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  28.35 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  24.51 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  24.13 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  24.57 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.12 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2779  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  26.55 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>