More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16160  type II secretion system protein  100 
 
 		 399 aa  804    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.996237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29500  putative type II secretion system protein  45.61 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2647  type II secretion system protein  41.4 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3231  type II secretion system protein  37.72 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0387255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  27.25 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  24.94 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  24.5 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  29 
 
 		 405 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  24.18 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  23.92 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  25.99 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.27 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  26.43 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  28.01 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  24.44 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  29.5 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  26.5 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  24.19 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  24.38 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  24.26 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  27 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  22.94 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  22.94 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  22.94 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  22.94 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  23.59 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  25.57 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  26.47 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.36 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  26.72 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  28.11 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  24.56 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  24.81 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  25.32 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  28.36 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  25.32 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  25.44 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  22.42 
 
 		 403 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  25.44 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  25.06 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  24.69 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  27.76 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  25.25 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  28.07 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1279  general secretion pathway protein F  25.94 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  22.44 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  25.5 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  24.56 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  28.15 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  23.88 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  23.44 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  24.3 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  26.17 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 406 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  25 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  23.48 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 422 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  24.57 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  23.92 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  23.63 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  25.44 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  26.17 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  27.13 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0911  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.544826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  24.17 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  27.18 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  24.13 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  25.93 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  21.85 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>