More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3231 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3231  type II secretion system protein  100 
 
 		 396 aa  794    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0387255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2647  type II secretion system protein  38.29 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29500  putative type II secretion system protein  36.29 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16160  type II secretion system protein  37.72 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.996237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.11 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.19 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.55 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  24.55 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  24.41 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  25.93 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  26.41 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  25.68 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  25.68 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  25.68 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.63 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  25.68 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  27.25 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  26.3 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.09 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  24.16 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  25.68 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  24.78 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  23.96 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  25 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  26.41 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  26.61 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  25.92 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  28.93 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  26.65 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  27.34 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  27.09 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  22.72 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  28.17 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  26.03 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  26.65 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  27.22 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  26.5 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  27.07 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  25.51 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  25 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  26.91 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  27.07 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  25.45 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  23.53 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  26.55 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  26.98 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  22.12 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  23.68 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  26.75 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  24.94 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  23.91 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  25.51 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  25.81 
 
 		 407 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.74 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  25.71 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  24.4 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  24.07 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  29.45 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  23.62 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  23.2 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  25.06 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  21.63 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>