More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04541 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04541  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  593  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  44.36 
 
 
486 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12801  hypothetical protein  36.87 
 
 
339 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.103012 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  34.81 
 
 
421 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  51.76 
 
 
606 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 
2704 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.67 
 
 
1963 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.46 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  53.75 
 
 
686 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.16 
 
 
946 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  38.21 
 
 
2329 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.68 
 
 
1553 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  44.32 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  36.26 
 
 
938 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  53.62 
 
 
1538 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 
2537 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  49.41 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.78 
 
 
2885 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  41.98 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  50.67 
 
 
709 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  53.09 
 
 
2954 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
3954 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  34.33 
 
 
1166 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.39 
 
 
5962 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  49.4 
 
 
3314 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.84 
 
 
2667 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.25 
 
 
518 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  48.75 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.75 
 
 
813 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  36.81 
 
 
1594 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.19 
 
 
3427 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  52.63 
 
 
4791 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
2296 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.68 
 
 
3209 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
588 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  50 
 
 
3619 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40 
 
 
1424 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.67 
 
 
1236 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  50 
 
 
3619 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  44.71 
 
 
615 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.63 
 
 
2346 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.39 
 
 
5218 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  40.78 
 
 
1712 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.38 
 
 
4220 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  48 
 
 
6683 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.52 
 
 
868 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  48 
 
 
6662 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.43 
 
 
950 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  48 
 
 
6779 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  35.25 
 
 
744 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  42.11 
 
 
942 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  46.91 
 
 
1022 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 
1017 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  48.05 
 
 
2452 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.65 
 
 
2239 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.4 
 
 
1712 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  43.01 
 
 
1156 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 
539 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  31.95 
 
 
867 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.32 
 
 
2668 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  51.47 
 
 
709 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.3 
 
 
855 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  42.06 
 
 
1883 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  48.1 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40.4 
 
 
2775 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.94 
 
 
980 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  46.91 
 
 
2105 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 
851 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  44.09 
 
 
3598 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  48.1 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  46.07 
 
 
1699 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.84 
 
 
1279 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.12 
 
 
2678 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.25 
 
 
421 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  51.9 
 
 
202 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  51.9 
 
 
202 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  48.15 
 
 
526 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  45.57 
 
 
4723 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  37.29 
 
 
460 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  47.37 
 
 
1499 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.9 
 
 
4106 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 
467 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 
491 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  57.63 
 
 
2567 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  45 
 
 
1164 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.91 
 
 
7284 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 
615 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  47.5 
 
 
8682 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.25 
 
 
1372 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  32.65 
 
 
982 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.17 
 
 
5839 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 
1532 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  34.31 
 
 
1287 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  46.15 
 
 
833 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  41 
 
 
1346 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 
2836 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>