More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2973 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2973  diguanylate cyclase  100 
 
 		 679 aa  1393    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.439966  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 699 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3217  Cache sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 699 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3226  bacterioferritin  33.13 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  31.09 
 
 		 957 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 971 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 708 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3492  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1041 aa  229  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  25.7 
 
 		 830 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 679 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 682 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 970 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 906 aa  81.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.6 
 
 		 708 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.79 
 
 		 1240 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.19 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.19 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  31.5 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.56 
 
 		 353 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.4 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 621 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  29.3 
 
 		 680 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  31.88 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  37.09 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  30.73 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 291 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  29.11 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 625 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 625 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 880 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  33.53 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  30.5 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 625 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.34 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  26.32 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  24.09 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  28 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  28 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.27 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  27.56 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  31.54 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  25.21 
 
 		 785 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2661  diguanylate cyclase  24.07 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.646845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  27.68 
 
 		 591 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3042  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 388 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  27.85 
 
 		 340 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  20.95 
 
 		 569 aa  57  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.1 
 
 		 706 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1595  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 234 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 356 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1449  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.14 
 
 		 332 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2518  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.16 
 
 		 751 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00063624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  30.3 
 
 		 464 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  26.29 
 
 		 369 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.5 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  22.33 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  26.5 
 
 		 439 aa  55.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.76 
 
 		 710 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 681 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.45 
 
 		 632 aa  55.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  26.98 
 
 		 718 aa  55.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3483  diguanylate cyclase  27.19 
 
 		 409 aa  54.7  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0776435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  24.55 
 
 		 574 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.61 
 
 		 596 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  22.1 
 
 		 422 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  26.7 
 
 		 627 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 374 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.85 
 
 		 894 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.19 
 
 		 1267 aa  55.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0138  diguanylate cyclase  35.14 
 
 		 355 aa  54.7  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  28.76 
 
 		 736 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.81 
 
 		 775 aa  54.7  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.21 
 
 		 657 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1012  diguanylate cyclase  29.83 
 
 		 295 aa  54.7  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  23.93 
 
 		 237 aa  54.7  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  27.89 
 
 		 641 aa  54.7  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 485 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  26.83 
 
 		 490 aa  54.3  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 569 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  24.31 
 
 		 503 aa  54.3  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0686  GGDEF/HAMP domain-containing protein  24.12 
 
 		 427 aa  53.9  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  28.71 
 
 		 638 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3966  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.14 
 
 		 332 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  31.14 
 
 		 624 aa  53.9  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  29.14 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  26.61 
 
 		 1188 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  28.3 
 
 		 357 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  30.36 
 
 		 350 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>