More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2236 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 322 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  57.23 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  58.93 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  38.34 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  41.92 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  39.31 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  39.87 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.9 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  38.75 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  41.12 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.94 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  40.07 
 
 		 304 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.21 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  40.75 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.75 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.75 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  41.01 
 
 		 341 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  40.53 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.24 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.85 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.26 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  40.4 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.48 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.63 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  38.27 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 345 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  38.11 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.99 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  39.13 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.67 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  36.09 
 
 		 807 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  41.45 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  36.05 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  37.07 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  41.09 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  38.16 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.67 
 
 		 364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  34.94 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  37.27 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  32.38 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  36.75 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  44.49 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.27 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  31.75 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  40.41 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.12 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.18 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.23 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  36.02 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  40.15 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  32.53 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  34.23 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  36.4 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  39.81 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  34.47 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  38.91 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  36.45 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  33.9 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  34.88 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  33.75 
 
 		 480 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  33.9 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  32.58 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  36.18 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  41.37 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  34.68 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  34.8 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  38.04 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  39.64 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  38.08 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  33.9 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  37.79 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  34.75 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  36.05 
 
 		 737 aa  149  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  34.17 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  37.75 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  36.51 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  35.23 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3438  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0165681  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  37.75 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  34.35 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  36.45 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  34.36 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  36.45 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>