More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2481 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  100 
 
 		 309 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  73.79 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  72.82 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  72.82 
 
 		 309 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  72.17 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  72.82 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  70.23 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  62.99 
 
 		 309 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  61.36 
 
 		 309 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  59.74 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  58.77 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  59.09 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  58.5 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  59.09 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  56.07 
 
 		 311 aa  357  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  55.88 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  56.82 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  54.69 
 
 		 348 aa  352  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  55.74 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  55.88 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  53.25 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  55.17 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  53.5 
 
 		 337 aa  329  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  52.87 
 
 		 316 aa  328  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  53.18 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  51.31 
 
 		 307 aa  318  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  50.32 
 
 		 313 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  52.94 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  53.27 
 
 		 307 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  52.79 
 
 		 314 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  52.29 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  52.29 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  52.61 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  50.8 
 
 		 347 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  49.84 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  51.14 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  46.6 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  48.37 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  49.35 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  48.04 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  48.68 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  48.21 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  43.32 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  42.81 
 
 		 321 aa  262  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  46.28 
 
 		 307 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  44.01 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  45.63 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  44.44 
 
 		 308 aa  258  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 317 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  47.88 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  46.25 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  43.65 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  45.93 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  43.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  43.55 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  46.65 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  44.84 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  45.93 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  43.18 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  43.69 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  41.56 
 
 		 306 aa  245  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  46.73 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  43.87 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  46.13 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  43.27 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  41.85 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  43.35 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  42.91 
 
 		 304 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  46.25 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  43.21 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  42.04 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  43.45 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  42.39 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  41.59 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  42 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  49.17 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  40.95 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  40.95 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  48.04 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  41.08 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.26 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  43.39 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>