More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2616 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  56.03 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  54.69 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  54.07 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  54.72 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  53.75 
 
 		 309 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  57.98 
 
 		 309 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  53.75 
 
 		 309 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  53.75 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  53.42 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  54.37 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  53.72 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  52.94 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  53.07 
 
 		 325 aa  315  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  51.79 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  52.12 
 
 		 309 aa  311  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  54.37 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  51.9 
 
 		 316 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  52.43 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  53.57 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  50.32 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  50.32 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  52.77 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  50.32 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  49.51 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  50 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  53.53 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  49.84 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  49.19 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  48.39 
 
 		 311 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  54.22 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  49.35 
 
 		 308 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  46.6 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  51.47 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  47.74 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  49.51 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  47.39 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  45.1 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  45.78 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  45.45 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  44.63 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  47.57 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  47.25 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  46.75 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  47.25 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  42.39 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  50.81 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  44.84 
 
 		 314 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  47.42 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  45.63 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  43.32 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  45.63 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  45.95 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  46.25 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  41.94 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  44.3 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  44.98 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  50 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  43.97 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  44.95 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  44.95 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  44.95 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  45.28 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  45.28 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  41.61 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  44.16 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  50.5 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  42.33 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  44.67 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  39.68 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  41.59 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  44.01 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  41.03 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  43.84 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  38.56 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  39.93 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  39.06 
 
 		 304 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.44 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  36.6 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  36.96 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.8 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  45.48 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>