More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0330 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  100 
 
 		 341 aa  700    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  90.32 
 
 		 341 aa  643    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  85.59 
 
 		 341 aa  607  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  42.06 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  44.3 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.17 
 
 		 343 aa  245  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.64 
 
 		 345 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  40.26 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.87 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  40.26 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  40.33 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  41.87 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  39.94 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  40.45 
 
 		 304 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  41.67 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  39.48 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  38.82 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  38.94 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  40.41 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  40.67 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.88 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  40.83 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  37.14 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  39.87 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  38.92 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  43.43 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  38.29 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  39.87 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  37.7 
 
 		 379 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.23 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  38.61 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  40.33 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  40.13 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  38.87 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  36.98 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  41.04 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  39.22 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  37.71 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  40.13 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  39.81 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  39.02 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  36.73 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.7 
 
 		 311 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  39.02 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.71 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  40.68 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  39.48 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  37.09 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  39.4 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  40.34 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  38.03 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  37.15 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  40.2 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.12 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  36.22 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  37.7 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 		 307 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  37.99 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  39.81 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  38.38 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.69 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  38.98 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.9 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  37.54 
 
 		 344 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.88 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  37.58 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  38.98 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  34.6 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  39.67 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.34 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  36.89 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  35.92 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.14 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  38.46 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  38.46 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  38.46 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  37.91 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>