More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0733 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 307 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  85.29 
 
 		 307 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  79.08 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  78.1 
 
 		 307 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  78.43 
 
 		 307 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  64.38 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  68.09 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  67.43 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  66.78 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  66.78 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  67.76 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  65.46 
 
 		 307 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  66.45 
 
 		 307 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  67.65 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  65.79 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  66.12 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  66.12 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  65.13 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  59.87 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  62.74 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  63.69 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  60.19 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  62.34 
 
 		 313 aa  364  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  60.51 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  56.39 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  60.19 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  58.6 
 
 		 317 aa  355  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  57.38 
 
 		 308 aa  354  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  55.74 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  59.87 
 
 		 319 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  59.55 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  57.33 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  57.47 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  55.08 
 
 		 334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  50.33 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  55.92 
 
 		 307 aa  311  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  52.43 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  48.68 
 
 		 307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  51.3 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  49.51 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  53.4 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  52.77 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  48.36 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  47.25 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.03 
 
 		 326 aa  281  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  49.35 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  46.23 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  48.05 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  48.38 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  50.49 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  48.38 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  48.39 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  48.06 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  47.25 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  46.45 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  45.81 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  46.13 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  45.16 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  46.35 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  46.95 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  46.13 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  45.81 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  45.85 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  44.48 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  45.13 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  44.81 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  44.81 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  45.81 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  46.91 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  44.48 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  44.95 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  44.16 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  47.08 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  45.02 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  43.85 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  45.45 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  45.83 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  43.46 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  43.46 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  44.01 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  42.44 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  45.48 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  46.62 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  45.16 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  46.77 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  45.16 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  48.17 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  42.27 
 
 		 343 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  47.7 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  39.29 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  39.81 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>