More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0952 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
307 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  68.63 
 
 
307 aa  421  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  51.79 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  54.07 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  53.09 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  52.77 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  51.14 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  50.49 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  51.47 
 
 
309 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  49.51 
 
 
325 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  52.92 
 
 
309 aa  292  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  49.19 
 
 
309 aa  292  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  49.19 
 
 
309 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  49.51 
 
 
323 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  50.49 
 
 
308 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  49.19 
 
 
309 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  49.51 
 
 
309 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  49.84 
 
 
309 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  49.19 
 
 
309 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  49.67 
 
 
308 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  47.71 
 
 
306 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  47.77 
 
 
337 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  48.04 
 
 
314 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  48.04 
 
 
309 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  48.04 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  51.31 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  47.45 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  48.21 
 
 
309 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  51.31 
 
 
307 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  47.23 
 
 
348 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  49.04 
 
 
317 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  50.98 
 
 
307 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  46.82 
 
 
316 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  46.91 
 
 
309 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  47.35 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  46.89 
 
 
308 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  45.95 
 
 
313 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  50 
 
 
347 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  46.28 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  45.63 
 
 
311 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  47.71 
 
 
321 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  47.23 
 
 
305 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  46.25 
 
 
308 aa  265  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 
309 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  46.6 
 
 
311 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  43.97 
 
 
309 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  48.04 
 
 
307 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  48.04 
 
 
307 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 
312 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  50.49 
 
 
307 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 
307 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  48.37 
 
 
307 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  48.69 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  48.37 
 
 
307 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  45.78 
 
 
314 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  47.39 
 
 
307 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  49.84 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  47.39 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  46.84 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  47.39 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 
307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  47.04 
 
 
319 aa  251  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  44.63 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 
307 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  48.2 
 
 
306 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  50.16 
 
 
307 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.17 
 
 
326 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  44.64 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  45.6 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  46.96 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  46.91 
 
 
334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  46.77 
 
 
311 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  47.59 
 
 
313 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  44.63 
 
 
307 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  47.71 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  41.94 
 
 
310 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  41.5 
 
 
308 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  47.02 
 
 
312 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  48.84 
 
 
302 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  46.82 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  45.08 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  44.09 
 
 
315 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  43.22 
 
 
317 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  43.45 
 
 
318 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  42.68 
 
 
319 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  41.72 
 
 
306 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  42.68 
 
 
319 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  43.63 
 
 
317 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.58 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  39.94 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.12 
 
 
306 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>