More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0855 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 306 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  44.37 
 
 		 307 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  43.18 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  43.43 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  43 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  43 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  43.32 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  41.83 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  42.57 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  41.23 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  42.76 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.56 
 
 		 309 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  43.42 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  41.16 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  41.47 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  42.11 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  43.65 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  42.67 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  43.97 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  43.32 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  43 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  45.39 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  40.84 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  43.87 
 
 		 347 aa  231  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  43.93 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  42.12 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.07 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  41.75 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  42.52 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  40 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  40.4 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  43.61 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  42.57 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  40.33 
 
 		 308 aa  224  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  41.1 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.29 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  41.39 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  40.47 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  40.73 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  40.33 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  39 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  41.72 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  39.07 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  41.58 
 
 		 319 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  39.87 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  39.35 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.41 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.09 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  38.41 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  40.13 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  40.33 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  45.31 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.29 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  39.23 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  41.83 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  37.91 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  37.74 
 
 		 317 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  36.25 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  36.36 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  36.36 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  41.72 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>