More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0772 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
306 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  60.8 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  60.8 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  62.25 
 
 
306 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  61.97 
 
 
308 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  62 
 
 
304 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  58.53 
 
 
306 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  60.46 
 
 
323 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  40.45 
 
 
341 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  40.66 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  40.33 
 
 
341 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  40.19 
 
 
306 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  40.65 
 
 
344 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  44.04 
 
 
308 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  43.43 
 
 
309 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  41.84 
 
 
309 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  39.87 
 
 
309 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  41.53 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  42.19 
 
 
307 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 
309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.35 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.37 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.03 
 
 
316 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  41.45 
 
 
311 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 
316 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  39.68 
 
 
334 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 
309 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  40.56 
 
 
309 aa  209  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  43.09 
 
 
314 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  40.79 
 
 
311 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.96 
 
 
344 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  40.33 
 
 
309 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 
309 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  39.02 
 
 
311 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 
312 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  41.02 
 
 
323 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  40.8 
 
 
306 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  39.31 
 
 
328 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  38.91 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  38.21 
 
 
325 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  40.67 
 
 
307 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  37.34 
 
 
309 aa  202  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  40.58 
 
 
313 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  41.33 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  38.29 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.78 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.97 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  39.46 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  40.67 
 
 
307 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  40.33 
 
 
307 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  38.82 
 
 
317 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  38.98 
 
 
308 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  40.8 
 
 
307 aa  199  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.4 
 
 
343 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  38.44 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  39.73 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.03 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  41.89 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.17 
 
 
352 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.62 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  38.06 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 
314 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  39.02 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  43.4 
 
 
324 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  43.4 
 
 
307 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 
307 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 
343 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 
307 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 
306 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  37.7 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  37.86 
 
 
345 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 
321 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.06 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.91 
 
 
309 aa  189  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 
345 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  38.72 
 
 
334 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 
319 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  38.78 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  35.81 
 
 
308 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  39.94 
 
 
308 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.95 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.09 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 
364 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  40.34 
 
 
330 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  36.75 
 
 
307 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  37.92 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  38.24 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  37.16 
 
 
307 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  39.06 
 
 
313 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  37.16 
 
 
307 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 
307 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  37.16 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  37.16 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  37.16 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>