More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0936 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 316 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  44.83 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 344 aa  244  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  43.54 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  39.87 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  40.32 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  41.99 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  40.51 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  42.33 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  38.59 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  40.97 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  40.27 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  42.76 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  40.26 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  43.23 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  40.26 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  40.65 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  40.51 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  37.9 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.57 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  42.26 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  40.84 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  39.41 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  38.94 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  39.49 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39.6 
 
 		 340 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  40.89 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.59 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  38.99 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  41.25 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  38.22 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  37.01 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  36.92 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.9 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  37.9 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  43.14 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  39.49 
 
 		 325 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.28 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  35.58 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  38.28 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  40.07 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.03 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  39.6 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  42.05 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  39.74 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  38.02 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  39.24 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  37.7 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  37.18 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.95 
 
 		 370 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  39.13 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  40.35 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  37.85 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  34.42 
 
 		 737 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  37.7 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  36.83 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  35.24 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  37.46 
 
 		 304 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  39 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  34.84 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  38.67 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  38.61 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  38.99 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  38.12 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  38.29 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  38.12 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  38.12 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  38.12 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  36.81 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  38.12 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  36.1 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  38.12 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  36.42 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.11 
 
 		 380 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.11 
 
 		 380 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  36.81 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  37.15 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  38.61 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  37.15 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  36.22 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  35.91 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  39.31 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.41 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>