More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4049 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  100 
 
 		 359 aa  709    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  47.23 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  44.31 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  45 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  42.04 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  39.86 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  37.01 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  44.41 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  42.47 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  38.74 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  45.62 
 
 		 341 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.06 
 
 		 334 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.42 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.58 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  42.99 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  43.14 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  42.81 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37.03 
 
 		 341 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  47.1 
 
 		 365 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  36.49 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  42.47 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  43.62 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  43.31 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  41.5 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  42.76 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  40.6 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  38.8 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  42.49 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  39.87 
 
 		 306 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 323 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  43.23 
 
 		 347 aa  212  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  41.02 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  41.02 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  42.12 
 
 		 311 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  42.3 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.99 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  41.67 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  43.99 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  43.24 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  42.22 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  40.38 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  39.26 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  42.95 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  45.15 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.3 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  40.78 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  41.95 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  38.51 
 
 		 304 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  41.72 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  38.65 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  39.37 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  40.89 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  38.02 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  40.31 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  41.94 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  37.58 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  38.93 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  41.29 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.55 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  43.52 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  38.96 
 
 		 309 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  42.5 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  39.62 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  39.08 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  39.18 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  39.54 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.58 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  37.01 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  38.81 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  36.42 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  38.91 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.9 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  41.12 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  40.64 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  38.91 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  51.56 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  44.44 
 
 		 373 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  39.1 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  42.11 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  41.08 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  40.82 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  39.87 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.13 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  43.85 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  39.72 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.42 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  39.48 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  39.58 
 
 		 369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>