More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0721 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 322 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.23 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.42 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.65 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.02 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  34.02 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  36.84 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  35.13 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  35.74 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.63 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  34.8 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.55 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  32.82 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  31.29 
 
 		 345 aa  185  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.8 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  34.63 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  34.44 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  35.84 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  36.21 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.37 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  36.86 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.64 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  35.58 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  35.97 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.25 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  34.21 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  33.55 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  40.77 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  40.77 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  32.61 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  32.83 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  34.29 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.28 
 
 		 352 aa  175  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  34.77 
 
 		 528 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.77 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  32.9 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  32.63 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  34.95 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  34.94 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  36.88 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  38.15 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  38.15 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  36.07 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  36.43 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  38.04 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  34.71 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  38.75 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  36.27 
 
 		 441 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  34.84 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.49 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  33.82 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.23 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  35.43 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  35.2 
 
 		 447 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30.91 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  34.14 
 
 		 438 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  37.25 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  35.53 
 
 		 451 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  33.33 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  34.95 
 
 		 450 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  31.51 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  32.89 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  34.77 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 438 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  34.35 
 
 		 369 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  34.77 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  33.12 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.03 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  31.09 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  33.02 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  32.13 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  35.16 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  32.33 
 
 		 737 aa  162  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  30.97 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  33.57 
 
 		 766 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  42.64 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  30.66 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  34.88 
 
 		 304 aa  162  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  31.09 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.62 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  32.21 
 
 		 438 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  30.95 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>