More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1974 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 345 aa  706    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  38.41 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.42 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.28 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 		 331 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.58 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  40.63 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.65 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  37.35 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  35.58 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  38.13 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.47 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.03 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  40.86 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  33.86 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  33.76 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  31.29 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.91 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.87 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  37.29 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  35.93 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  37.93 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  37.82 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  36.5 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  42.18 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  34.39 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  37.38 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  33.99 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  37.25 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  33.99 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  33.78 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  34.11 
 
 		 309 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.91 
 
 		 380 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.79 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  31.52 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.74 
 
 		 380 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  34.25 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  36.95 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.75 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  37.87 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  34.88 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.4 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  33.23 
 
 		 306 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  33.56 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.97 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  36.33 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  33.67 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  36.64 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  35.67 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  35.31 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.94 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  37.23 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 314 aa  167  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.55 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.07 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  36.64 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  36.88 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  34.75 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  37.23 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  36.12 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  35.4 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  32.67 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  31.48 
 
 		 807 aa  162  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  35.1 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  35.6 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  33.56 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  31.06 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  35.22 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  34.36 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  34.36 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  34.33 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  34.78 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  33.44 
 
 		 304 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  34.03 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  31.91 
 
 		 766 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  35.55 
 
 		 307 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 369 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  31.85 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  32.7 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  35.55 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  32.05 
 
 		 737 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  33.66 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>