More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4443 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 306 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  74.67 
 
 		 304 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  69.61 
 
 		 308 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  64.78 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  62.83 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  62.5 
 
 		 312 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  62.25 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  57.7 
 
 		 323 aa  330  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  41.72 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  41.4 
 
 		 344 aa  231  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  41.58 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  42 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 		 309 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  42.57 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  38.74 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 		 341 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.74 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.94 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  37.14 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.56 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  39.4 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  37.94 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  41.16 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  38.44 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  39.87 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  38.28 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  38.11 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  40.74 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  39.53 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  39.32 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  39.34 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  39.4 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  40.71 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  38.28 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  39.12 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  40.07 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  38.61 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  38.94 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  40.26 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  38.28 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.66 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  40.26 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  39.08 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  39.08 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  38.08 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.33 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  38.39 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  38.56 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  37.75 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  36.63 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  35.86 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  39.39 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.91 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  37.75 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.73 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  38.73 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  37.42 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  35.55 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  38.72 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  35.55 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.46 
 
 		 343 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.84 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.75 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  41.33 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  37.67 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.5 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  35.28 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  38.16 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  39 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  38.33 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  38.05 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.34 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.25 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  35.48 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.21 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  37.93 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  34.23 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  37.67 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  36.91 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.57 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  36.91 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  36.91 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  36.91 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  36.91 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>