More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0676 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 344 aa  707    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  51.15 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  46.47 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  44.62 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  42.72 
 
 		 309 aa  261  8.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  45.11 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  40.77 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  45.05 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.22 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  44.3 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  43.69 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  45.12 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  44.63 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  44.66 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  45.03 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  44.05 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  47.87 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  41.16 
 
 		 306 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  43.69 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  45 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  39.7 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  43.73 
 
 		 309 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  44.44 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.77 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  41.08 
 
 		 304 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  44.13 
 
 		 311 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  41.4 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39.61 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  40.24 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  40.24 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  43.4 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42.21 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  40.65 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  41.35 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  43.65 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  40.91 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  41.19 
 
 		 316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  36.8 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  43.23 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  43.18 
 
 		 323 aa  222  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  42.95 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  41.75 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  41.29 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  41.78 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  41.56 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.78 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  41.48 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.78 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.89 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  36.13 
 
 		 737 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  41.42 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  40.45 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  41.18 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  41.42 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  38.31 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  40.13 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  43.27 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  40.78 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  43.25 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  45.12 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.91 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  41.07 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  40.13 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  41.88 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  40.67 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  39.94 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  41.4 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  41.84 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  38.34 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  40.67 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  40.32 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  40.45 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  38.98 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  39.29 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  38.32 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  35.27 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  36.72 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  35.41 
 
 		 807 aa  199  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  41.34 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  41.01 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  41.94 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  42.76 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  41.56 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  40.95 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  38.76 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>