More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4185 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 308 aa  641    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  69.61 
 
 		 306 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  65.36 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  65.36 
 
 		 312 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  66.12 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  61.56 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  61.97 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  56.86 
 
 		 323 aa  328  6e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  41.83 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  42.62 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  42.28 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  41.35 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.28 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  38.91 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  41.35 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  39.3 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  40.13 
 
 		 337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  39.6 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  38.36 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  40.13 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  39.67 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  38.71 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  36.98 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.3 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  38.61 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.69 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.62 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.75 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  38.28 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  37.33 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  38.34 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.11 
 
 		 340 aa  198  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  37.79 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  38.31 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.13 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  35.64 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.12 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  39.87 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  38.96 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  37.46 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  39.1 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  33.9 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  35.64 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  36.51 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  36.01 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  37.85 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  38.46 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.12 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.3 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  36.45 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  38.24 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  40.34 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  37.62 
 
 		 343 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  39.32 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  34.13 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  37.13 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0844  histone deacetylase superfamily protein  41.22 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.18 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.19 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  34.39 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  37.21 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  37.83 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  38.08 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  34.13 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  33.22 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  32.48 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  36.19 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  36.42 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  36.22 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>