More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1947 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 343 aa  694    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  49.12 
 
 		 344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  45.16 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  46.39 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  44.2 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  43.89 
 
 		 316 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  45.27 
 
 		 331 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  44.37 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42.98 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  46.94 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  40.17 
 
 		 341 aa  245  6e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  42.49 
 
 		 311 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  44.11 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  42.81 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  42.49 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.85 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  44.09 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  37.32 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  43.54 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  40.75 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  38.15 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  41.8 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.76 
 
 		 310 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  41.74 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  40.76 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  40.45 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  41.8 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  41.8 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  41.48 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  40.76 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  38.26 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  41.36 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  42.62 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  42.71 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  43.17 
 
 		 306 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  40.98 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  40.2 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  37.5 
 
 		 399 aa  215  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  37.5 
 
 		 399 aa  215  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  42.43 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  39.16 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  42.33 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  43.39 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  42.14 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.04 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.56 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.39 
 
 		 380 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  39.55 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  38.8 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  46.39 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 307 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  41.14 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  40.84 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  40.89 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  42.71 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  38.69 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.81 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  40.58 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  40.39 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  40.55 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  36.07 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  37.25 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.49 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  39.46 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  41.72 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.49 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 370 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  40.4 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.5 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  38.44 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  44.3 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  39.26 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  40.79 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  40.63 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  35.58 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.93 
 
 		 371 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  41.25 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  38.08 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  38.82 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  40.48 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  37.67 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  39.2 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  42.76 
 
 		 330 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  39.34 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  40.07 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  40.07 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  40.07 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>