More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0616 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 370 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  69.19 
 
 		 380 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  68.92 
 
 		 380 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  63.41 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  62.67 
 
 		 369 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  63.49 
 
 		 369 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  63.22 
 
 		 369 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  63.22 
 
 		 369 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  62.4 
 
 		 369 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  63.32 
 
 		 373 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  64.93 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  61.2 
 
 		 369 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  64.38 
 
 		 367 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  59.84 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  64.66 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  64.38 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  64.79 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  65.09 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  64.5 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  56.44 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  55.77 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  55.49 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  53.13 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  45.01 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  45.61 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  41.42 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  41.42 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  41.42 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.42 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  41.12 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  43.09 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  40.83 
 
 		 370 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  42.76 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  35.82 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.26 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  38.04 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.07 
 
 		 343 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.27 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  33.64 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.25 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  36.27 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  32.94 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.43 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  36.69 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.94 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  37.32 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  37.63 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  33.23 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37.45 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  36.96 
 
 		 341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  35.84 
 
 		 321 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  41.76 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  33.54 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  36.77 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  35.12 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.49 
 
 		 309 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  38.4 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  37.93 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.91 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  37.41 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  35.84 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  36.59 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  37.19 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.16 
 
 		 347 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  35.13 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  37.17 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  37.19 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.7 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  37.81 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.51 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  33.44 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  36.59 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  34.9 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  34.9 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  31.52 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  36.59 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  33.22 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  35.37 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.42 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  34.08 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.36 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  36.58 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  33.78 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.08 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  36.4 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  34.64 
 
 		 309 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  34.86 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>