More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2560 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  99.67 
 
 
307 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  99.02 
 
 
307 aa  630  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  89.9 
 
 
307 aa  550  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  89.25 
 
 
307 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  89.25 
 
 
307 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  89.25 
 
 
307 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  89.25 
 
 
307 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  88.93 
 
 
307 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  88.27 
 
 
307 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  77.52 
 
 
334 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  78.18 
 
 
307 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  76.87 
 
 
307 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  68.52 
 
 
307 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  68.85 
 
 
307 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  67.87 
 
 
307 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  62.21 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  61.86 
 
 
317 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  65.13 
 
 
307 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  68.09 
 
 
307 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  58.75 
 
 
321 aa  374  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  57.19 
 
 
308 aa  367  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  60.26 
 
 
317 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  58.33 
 
 
317 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  62.38 
 
 
313 aa  361  8e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  57.7 
 
 
314 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  58.6 
 
 
315 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  57.96 
 
 
317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  57.43 
 
 
308 aa  352  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  57.05 
 
 
318 aa  348  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  57.56 
 
 
311 aa  348  9e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  57.37 
 
 
319 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  57.33 
 
 
334 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  57.05 
 
 
319 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  55.13 
 
 
317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  57.65 
 
 
307 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  52.13 
 
 
305 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  55.52 
 
 
308 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  51.95 
 
 
310 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  49.84 
 
 
307 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  47.7 
 
 
307 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  53.8 
 
 
307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  48.53 
 
 
312 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  48.53 
 
 
307 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  47.88 
 
 
308 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  47.47 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  47.9 
 
 
308 aa  278  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  47.23 
 
 
348 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  46.91 
 
 
326 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  46.95 
 
 
309 aa  275  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  46.6 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  46.93 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  46.28 
 
 
313 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  47.25 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  50 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  46.3 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  46.28 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  46.93 
 
 
309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  46.28 
 
 
309 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 
323 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  47.71 
 
 
307 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  45.62 
 
 
337 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  43.04 
 
 
309 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  45.28 
 
 
308 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  45.02 
 
 
309 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  45.6 
 
 
314 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  45.1 
 
 
307 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  46.6 
 
 
309 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  45.34 
 
 
309 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  45.31 
 
 
316 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  45.34 
 
 
325 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  44.69 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  45.81 
 
 
347 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 
309 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  45.14 
 
 
326 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  45.75 
 
 
307 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 
309 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  43.44 
 
 
316 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  46.43 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  43.65 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  43.59 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  42.63 
 
 
315 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 
306 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  43.91 
 
 
311 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  41.99 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  48.04 
 
 
306 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  48.5 
 
 
302 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  42.95 
 
 
319 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  42.21 
 
 
324 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  41.88 
 
 
307 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 
307 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  43.09 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  42.26 
 
 
344 aa  215  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0844  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 
310 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  46.69 
 
 
312 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>