More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1375 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  100 
 
 
312 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  99.68 
 
 
312 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  65.79 
 
 
306 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  65.36 
 
 
308 aa  421  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  62.83 
 
 
306 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  61.26 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  60.8 
 
 
306 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  55.63 
 
 
323 aa  326  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  40.59 
 
 
341 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  40.26 
 
 
341 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  40.26 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  42 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  36.54 
 
 
309 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  38.78 
 
 
344 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  39.39 
 
 
309 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  39.13 
 
 
309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  38.56 
 
 
337 aa  215  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  36.21 
 
 
309 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.54 
 
 
316 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  40.2 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  38.05 
 
 
309 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  38.24 
 
 
316 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 
309 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  36.6 
 
 
309 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.38 
 
 
309 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.27 
 
 
309 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 
306 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.92 
 
 
310 aa  208  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  38.03 
 
 
334 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.91 
 
 
311 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  40.47 
 
 
309 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  38.57 
 
 
311 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 
352 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  41.37 
 
 
314 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.28 
 
 
344 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  37.7 
 
 
307 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  38.21 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 
308 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.49 
 
 
343 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 
323 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.03 
 
 
309 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.75 
 
 
347 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  38.26 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  36.6 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  35.88 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.38 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  34.65 
 
 
325 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 
315 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  38.68 
 
 
307 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  38.36 
 
 
311 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 
307 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 
331 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.72 
 
 
341 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  39 
 
 
307 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.88 
 
 
364 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  34.8 
 
 
348 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  38 
 
 
307 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 
328 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  34.47 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  36.16 
 
 
335 aa  189  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  37.42 
 
 
343 aa  189  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 
306 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 
307 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.41 
 
 
316 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  37.33 
 
 
307 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  35.23 
 
 
307 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  37.01 
 
 
319 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  37.16 
 
 
307 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  38.69 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  36.07 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  37.26 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 
345 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  36.46 
 
 
307 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 
369 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  35.62 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  39.06 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 
307 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  38.75 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  39.33 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  36.21 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.83 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.31 
 
 
309 aa  179  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  37.66 
 
 
308 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.69 
 
 
371 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  37 
 
 
307 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  38.33 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.81 
 
 
380 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 
307 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>