More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0778 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 309 aa  630  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  57.93 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  57.98 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  56.86 
 
 		 307 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  52.87 
 
 		 316 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  59.74 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  55.37 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  51.59 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  54.72 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  51.27 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  55.05 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  53.42 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  54.58 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  56.21 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  53.75 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  51.79 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  54.07 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  53.4 
 
 		 313 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  52.61 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  52.61 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  54.19 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  53.09 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  53.09 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  52.77 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  52.77 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  54.4 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  51.29 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  50.49 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  50.16 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  49.84 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  49.51 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  50.49 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  49.51 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  48.86 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  48.84 
 
 		 307 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  49.51 
 
 		 311 aa  291  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  45.31 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  49.14 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  51.79 
 
 		 324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  52.44 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  51.79 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  50.99 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  46.56 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  47.71 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  48.38 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  47.21 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  49.03 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  44.63 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  52.98 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  47.73 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  43.51 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  46.41 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  45.42 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  46.89 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  47.08 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  47.06 
 
 		 334 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  51.14 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  47.08 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  46.08 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  46.1 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  45.78 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  45.45 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  46.1 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  45.78 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  44.05 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  44.63 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  46.44 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  43.65 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  44.77 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  44.09 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  40.97 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  42.02 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  42.71 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  41.23 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  46.58 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  43.05 
 
 		 341 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  43.37 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  41.56 
 
 		 341 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  43.45 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  40.07 
 
 		 312 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  41.23 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  40.07 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  41.28 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  44.37 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  41.59 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  41.16 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>