More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0570 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 311 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  94.53 
 
 		 311 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  81.99 
 
 		 311 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  75.56 
 
 		 309 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  69.4 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  68.77 
 
 		 337 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  69.09 
 
 		 316 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  63.99 
 
 		 308 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  58.25 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  56.96 
 
 		 309 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  55.74 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  53.72 
 
 		 309 aa  348  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  54.69 
 
 		 309 aa  348  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  52.75 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  52.43 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  55.66 
 
 		 348 aa  342  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  52.43 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  55.66 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  55.66 
 
 		 328 aa  340  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  55.99 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  53.7 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  55.02 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  51.46 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  50.97 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  54.61 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  53.05 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  51.16 
 
 		 307 aa  305  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  50.32 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  50.48 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  46.95 
 
 		 308 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  50.49 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  51.19 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  49.15 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  48.51 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  48.81 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  49.68 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.87 
 
 		 310 aa  272  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  46.28 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  45.13 
 
 		 314 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  45.75 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  45.83 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  44.98 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  43.32 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  42.49 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  44.23 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  45.93 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  44.25 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  41.97 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  43.79 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  44.13 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  42.81 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  41.94 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  45.4 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  43.23 
 
 		 344 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  43.91 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  42.81 
 
 		 317 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  41.14 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  42.48 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  40.2 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  41.47 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  43.14 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  43.46 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  44.37 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  43.79 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0672  histone deacetylase superfamily  45.75 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0541472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  38.94 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  43.59 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  43.59 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  40.75 
 
 		 304 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04641  acetoin utilization family protein  47.51 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  43.27 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  44.77 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  42.63 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  42.95 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  44.18 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  42.48 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  42.95 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  42.95 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  42.63 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  42.63 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 		 345 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.59 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 		 364 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.53 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  42.04 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  39.4 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  41.21 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  42.56 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>