More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0929 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 364 aa  749    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  44.03 
 
 		 446 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  42.65 
 
 		 438 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  44.75 
 
 		 478 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  42.86 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  40.77 
 
 		 344 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  41.37 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  44.65 
 
 		 450 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  40.95 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  42.41 
 
 		 447 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  44.41 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 438 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  39.32 
 
 		 439 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  39.15 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  40.54 
 
 		 439 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  41.54 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  39.4 
 
 		 438 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.13 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  39.51 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  42.34 
 
 		 437 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.61 
 
 		 337 aa  224  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.67 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  40.27 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.29 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.55 
 
 		 316 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  40.57 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  40.88 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.41 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  38.17 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  41.03 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  37.62 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  37.3 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  41.77 
 
 		 473 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  39.73 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  37.67 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  38 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  40.15 
 
 		 370 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.98 
 
 		 345 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  39 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  35.78 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  38.8 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  39.33 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  37.13 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  37.25 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  37.25 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  36.67 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  34.22 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  36.91 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  36.05 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  35.51 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.67 
 
 		 308 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  35.47 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  35.47 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.88 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  35.88 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  37.63 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.54 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  37.33 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.29 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  37.17 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  35 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  36.24 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  35.67 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  36.3 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  33.81 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.61 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  35.14 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  33.62 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.89 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  38 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  36.55 
 
 		 321 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  34.8 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  37.2 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  35.03 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.79 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  35.88 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.01 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  37.16 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  37.5 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  33.33 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>