More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1012 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  100 
 
 		 351 aa  716    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  58.29 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  38.07 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  37.97 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  36.53 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.79 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  39.62 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  38.01 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  35.08 
 
 		 388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.77 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  36.36 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  34.77 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  36.07 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  39.12 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  34.46 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  34.46 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  34.46 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  39.24 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  34.46 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  34.46 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  34.46 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  34.46 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 388 aa  215  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  38.63 
 
 		 407 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  34.6 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  36.83 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.05 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.05 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  35.84 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  39.68 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  38.1 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  36.36 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.9 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  37.21 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  37.66 
 
 		 406 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  39.05 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  33.96 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.03 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  33.76 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.99 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.99 
 
 		 385 aa  198  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  36.04 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  34.89 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  35.74 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  36.09 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.12 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  31.66 
 
 		 410 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  32.92 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  33.22 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  39.68 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  34.52 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.23 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.87 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.92 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  32.04 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.97 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  34.66 
 
 		 659 aa  170  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  30.72 
 
 		 426 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  34.04 
 
 		 378 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.22 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  31.31 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  38.85 
 
 		 345 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.58 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.07 
 
 		 621 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.63 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.19 
 
 		 687 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.14 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  36.95 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.21 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.29 
 
 		 488 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.42 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 		 466 aa  155  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.76 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  34.88 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  36.6 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  32.14 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  32.63 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  30.95 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.57 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  28.31 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.72 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  30.82 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30.51 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30.51 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  35.29 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  31.1 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  30.23 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  30.29 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>