More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0778 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 435 aa  908    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  64.75 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  61.56 
 
 		 439 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  61.75 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  59.4 
 
 		 446 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  56.35 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  54.5 
 
 		 438 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  51.83 
 
 		 438 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  58.23 
 
 		 473 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  51.47 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  55.15 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  53.67 
 
 		 478 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  53.79 
 
 		 450 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  50.34 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  51.05 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  50.12 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  50.7 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  47.15 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  40.95 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.66 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.59 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  34.24 
 
 		 344 aa  161  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.54 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40.47 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.55 
 
 		 308 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 326 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 		 316 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  43.09 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  37.21 
 
 		 369 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  37.45 
 
 		 737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  39.47 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  32.9 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  43.48 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  42.7 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.65 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  39.02 
 
 		 365 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.45 
 
 		 309 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  31.36 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  35.52 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  38.39 
 
 		 334 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  42.13 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.43 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  34.74 
 
 		 313 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  31.91 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  32.27 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.27 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  40.21 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.65 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  36.6 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  32.24 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.77 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  36.6 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  31.43 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.53 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.85 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  34.91 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  33.56 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.78 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  31.91 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  34.31 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  34.32 
 
 		 336 aa  140  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  41.85 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  30.25 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.16 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  33.56 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  41.06 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  36.1 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  31.08 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  36.1 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  31.52 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  27.57 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.48 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  31.12 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  39.41 
 
 		 340 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  39.23 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  31.27 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  34.84 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  33.46 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 		 378 aa  136  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  32.42 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  34.39 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  34.7 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  29.7 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.33 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  35.94 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  31 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  36.1 
 
 		 367 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  28.62 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  41.21 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  35.44 
 
 		 330 aa  133  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  29.84 
 
 		 325 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 309 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>