More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0126 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 473 aa  969    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  61.24 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  63.07 
 
 		 439 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  61.93 
 
 		 439 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  58.08 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  55.73 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  57.24 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  55.58 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  54.61 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  52.49 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  52.98 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  52.27 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  52.63 
 
 		 451 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  53.55 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  53.76 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  52.17 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  50.57 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  46.77 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  37.22 
 
 		 331 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  44.14 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.64 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  45.58 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  37.12 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.43 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.6 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  42.15 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  34.83 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  35.87 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  37.59 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  36.25 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.83 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  46.32 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  40.25 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  40.34 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.87 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  40.51 
 
 		 337 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  36.11 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  39.11 
 
 		 309 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  34.82 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  39.86 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  35.94 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  34.08 
 
 		 346 aa  144  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  40.51 
 
 		 316 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.56 
 
 		 311 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  35.42 
 
 		 309 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  40.08 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  42.25 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 		 379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  47.69 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  36.67 
 
 		 737 aa  140  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  44.26 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  35.36 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.92 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  44.09 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  34.8 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  37.04 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  38.35 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.72 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  35.49 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  38.35 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  33.79 
 
 		 326 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  38.24 
 
 		 807 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 		 325 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.62 
 
 		 341 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  36.24 
 
 		 335 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  40.19 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  39.15 
 
 		 369 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  39.56 
 
 		 336 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  38.08 
 
 		 327 aa  136  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 369 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  38.12 
 
 		 378 aa  136  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  45.03 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  35.97 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  38.14 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  40.72 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  39.35 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.91 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  38.77 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  38.77 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.42 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  34.16 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  39.35 
 
 		 369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 369 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  38.17 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 309 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  39.9 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.65 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  39.04 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  33.77 
 
 		 341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  40.1 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  41.15 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.67 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  38.43 
 
 		 340 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 309 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>