More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2733 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 441 aa  915    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  52.68 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  49.1 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  50.11 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  51.27 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  50.68 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  49.89 
 
 		 528 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  49.09 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  48.62 
 
 		 439 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  48.03 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  47.67 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  45.9 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  47.15 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  46.17 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  47.64 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  46.17 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  46.98 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  39.51 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  38.99 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  43.7 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  35.55 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  39.08 
 
 		 308 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  41.85 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  41.3 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  39.42 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  35.79 
 
 		 326 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  35.23 
 
 		 309 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  34.63 
 
 		 309 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  43.48 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  38.55 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  41.86 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.57 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  38.15 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  47.28 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  34.78 
 
 		 309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  40.97 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  40.36 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  41.95 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  32.65 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  36.84 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 306 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  40.95 
 
 		 365 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  43.81 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  34.31 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  43.81 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  38.43 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.78 
 
 		 334 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  32.76 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.78 
 
 		 316 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.21 
 
 		 309 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  32.59 
 
 		 309 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  32.55 
 
 		 309 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  32.27 
 
 		 309 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  36.4 
 
 		 369 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  37.19 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  37.19 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  35.62 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  32.76 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  36.47 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  40.76 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  31.47 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  33.81 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  33.8 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  38.12 
 
 		 737 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  37.19 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  37.19 
 
 		 340 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  37.19 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  33.93 
 
 		 309 aa  137  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  33.8 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.89 
 
 		 311 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  37.19 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  33.44 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  37.24 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  45.36 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  34.72 
 
 		 307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.58 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  38.54 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  39.15 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.29 
 
 		 309 aa  133  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  37.93 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  33.71 
 
 		 370 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.83 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  43.96 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  41.67 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  31.85 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  40.98 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  40.98 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  43.41 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>