More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0991 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  100 
 
 		 327 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  33.62 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  34.91 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  34.72 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  35.5 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  34.02 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.04 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.38 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  33 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  38.4 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.45 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  34.87 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.2 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  32.42 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  41.62 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  43.24 
 
 		 438 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  35.25 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  41.92 
 
 		 528 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  33.9 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  36.16 
 
 		 446 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  32.8 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  35.03 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  42.06 
 
 		 451 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  39.91 
 
 		 478 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  33.33 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  33.66 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  36.47 
 
 		 441 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  33.97 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  32.38 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  31.51 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  31.58 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.71 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  41.06 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  31.77 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  31.42 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 438 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  38.39 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  33.66 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  32.19 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  32.68 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  34.38 
 
 		 304 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  39.61 
 
 		 439 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  44.57 
 
 		 447 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  32.78 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  31.13 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  31.97 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  30.79 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  32.46 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  39.9 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  31.15 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  30.77 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  30.94 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  31.82 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  31.69 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  32.13 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  29.97 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  30.72 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  32.05 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  41.03 
 
 		 473 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  30.89 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  30.91 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.56 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  31.9 
 
 		 807 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  30.1 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  33.47 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  34.21 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  33.56 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  36.02 
 
 		 480 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  29.25 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  28.93 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  31.13 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  32.04 
 
 		 370 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  30.19 
 
 		 737 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  29.72 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  31.13 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.13 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  29.97 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  31.1 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  30.42 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  29.62 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  27.99 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  29.62 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  29.39 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  34.78 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  28.31 
 
 		 766 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  28.21 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  33 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  29.52 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  30.87 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  31.6 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  28.61 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>