More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1126 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 336 aa  687    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  66.67 
 
 		 336 aa  485  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  69.35 
 
 		 336 aa  474  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  65.77 
 
 		 336 aa  472  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  46.29 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  35.99 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.54 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.86 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  39.75 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  39.23 
 
 		 359 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  35.46 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.17 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.68 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36.83 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  38.86 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.11 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  38.25 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  36.09 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  38.69 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  36.28 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.94 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  39.32 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.75 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  33.72 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.82 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  40.26 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.22 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  36.67 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  36.28 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  36.28 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.76 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  34.38 
 
 		 438 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  39.05 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  33.93 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.97 
 
 		 364 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  35.26 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.37 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.64 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  38.74 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  35.69 
 
 		 304 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.83 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  35.21 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  37.74 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.56 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  36.81 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  38.61 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  37.83 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  35.14 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  38.93 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.74 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 439 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  35.02 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  36.02 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  36.51 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  34.82 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  38.91 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  34.63 
 
 		 379 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  34.44 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  36.55 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  37.38 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  34.73 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  31.49 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  35.35 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  34.01 
 
 		 435 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  35 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  36.05 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  32.65 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  37.03 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  37.42 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  32.41 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  40.45 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  34.64 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  34.64 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  35.97 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  36.46 
 
 		 446 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  36.59 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  37.23 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  32.45 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  37.85 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  33.43 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  33.8 
 
 		 478 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.22 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>