More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0789 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 325 aa  664    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  49.21 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  37.99 
 
 		 347 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 577 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  36.78 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  36.78 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  36.47 
 
 		 347 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  36.54 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.59 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  35.56 
 
 		 343 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  37.9 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  34.95 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  37.1 
 
 		 578 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  35.44 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  35.24 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  37.26 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  36.74 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  37.06 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  35.87 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  35.26 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  38.73 
 
 		 582 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  37.08 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  35.37 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  38.22 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  34.82 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  38.22 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  35.9 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  37.01 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  40.76 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  33.92 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  34.03 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  37.31 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  34.14 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  33.04 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  33.24 
 
 		 359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  33.53 
 
 		 368 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  33.78 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  33.13 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  33.86 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  32.66 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  36.4 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.08 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  33.53 
 
 		 341 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  35.8 
 
 		 354 aa  175  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  34.08 
 
 		 340 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  30.41 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  34.41 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  31.16 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  39.91 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  32.69 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  36.68 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  37.3 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.89 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  31.09 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 		 341 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.91 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  31.6 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  34.25 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  38.6 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.95 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  35.48 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  33.23 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  41.26 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  31.38 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  29.81 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  32.99 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  34.71 
 
 		 347 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.59 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  31.06 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.67 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  32.65 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  33.45 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  37.31 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  32.42 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  31.6 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  40.91 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  31.94 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  31.4 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>