More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4058 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 438 aa  910    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  66.21 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  61.89 
 
 		 437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  61.29 
 
 		 439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  57.7 
 
 		 439 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  60.23 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  56.62 
 
 		 478 aa  534  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  54.46 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  56.42 
 
 		 528 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  56.48 
 
 		 446 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  56.35 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  56.09 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  53.67 
 
 		 448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  54.16 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  56.55 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  51.61 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  55.92 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  48.03 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  42.28 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.66 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  36.24 
 
 		 345 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.01 
 
 		 331 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  42.79 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.14 
 
 		 344 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  32.87 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  40.82 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 316 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  43.13 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  40.36 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  40.76 
 
 		 309 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  32.02 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  32.05 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  38.5 
 
 		 311 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  32.18 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  35.56 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.94 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  42.78 
 
 		 345 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  32.93 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.71 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  44.39 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  31.46 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  31.18 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  31.18 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.92 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 346 aa  143  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.06 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  34.55 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  34.48 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  36.86 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  36.86 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  36.4 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  39.01 
 
 		 311 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 365 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  38.05 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  35.32 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  32.19 
 
 		 336 aa  141  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.27 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  33.67 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  34.04 
 
 		 313 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  30.77 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  41.35 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  31.11 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  38.86 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.24 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  34.24 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  32.74 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  33.68 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  36.86 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  35.27 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  34.53 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  37.61 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  34.53 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 316 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 328 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  40.28 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.85 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.33 
 
 		 380 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  34.68 
 
 		 379 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  30.56 
 
 		 373 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.33 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  36.71 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  42.46 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  36.71 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  36.71 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  31.65 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  32.49 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  40.69 
 
 		 309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  32.79 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 314 aa  134  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  38.46 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.71 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  37.79 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  45.89 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>