More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0976 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  940    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  61.71 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  60.71 
 
 		 478 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  56.85 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  57.62 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  54.38 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  57.77 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  53.67 
 
 		 438 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  54.77 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  53.52 
 
 		 438 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  53.79 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  54.23 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  53.76 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  51.05 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  53.9 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  49.1 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  48.49 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  52.06 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 364 aa  259  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.18 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.16 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.16 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  41.6 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.62 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  39.65 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  42.13 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.09 
 
 		 308 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  36.24 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  35.59 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.01 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  35.96 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  35.23 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  36.49 
 
 		 309 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  35.23 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.91 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  35.81 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.36 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  39.13 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  34.85 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  39.13 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  35.19 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.37 
 
 		 323 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  38.16 
 
 		 369 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 		 309 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  39.13 
 
 		 369 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  34.37 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  41.71 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.39 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  38.33 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 369 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.8 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  38.7 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.35 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  34.93 
 
 		 309 aa  150  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.35 
 
 		 337 aa  150  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  40.49 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.47 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.79 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.02 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  40.93 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.78 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  33.86 
 
 		 306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  41.62 
 
 		 327 aa  146  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  38.89 
 
 		 316 aa  146  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  38.83 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  38.83 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 307 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  35.07 
 
 		 309 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  34.11 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.6 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  37.17 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  37.17 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  32.65 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  34 
 
 		 347 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.04 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  38.35 
 
 		 340 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  42.93 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  32.6 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  41.33 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  33.99 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  40.31 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  38.83 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  30.61 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  31.54 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  41.92 
 
 		 328 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  42.65 
 
 		 342 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  33.78 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.41 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  35.59 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  42.7 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>