More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4349 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 373 aa  758    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  69.81 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  64.84 
 
 		 369 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  63.46 
 
 		 369 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  63.46 
 
 		 369 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  63.19 
 
 		 369 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  63.19 
 
 		 369 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  65.11 
 
 		 373 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  62.81 
 
 		 371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  59.84 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  63.56 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  63.06 
 
 		 380 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  62.78 
 
 		 380 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  63.29 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  63.29 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  63.56 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  63.02 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  64.2 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  63.02 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  56.21 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  55.46 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  55.46 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  54.25 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  48.08 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  43.41 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  36.72 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.96 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  41.27 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  41.27 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  41.27 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.27 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  41.27 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  41.59 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  40.95 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  40.95 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  42.55 
 
 		 309 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  38.25 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  37.89 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  36.2 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  33.83 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  37.54 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.24 
 
 		 343 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  36.98 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  36.31 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.02 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37.19 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.47 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  35.02 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  31.42 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  41.63 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  37.31 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  37.31 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  34.66 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  39.91 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.68 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  39.66 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  39.04 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  35.05 
 
 		 337 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.91 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  40.22 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.01 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  43.21 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  41.23 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.56 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.41 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  34.5 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  38.69 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  43.15 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  40.87 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  39.74 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  41.7 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  38.06 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  32.59 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  38.06 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  35.56 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 308 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  30.79 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 		 309 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  41.15 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  33 
 
 		 304 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  33.65 
 
 		 737 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  34.65 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  33.02 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  38.6 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  34.38 
 
 		 766 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.45 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  34.11 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  37.65 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>