More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0125 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  99.73 
 
 
370 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  99.43 
 
 
350 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  99.71 
 
 
350 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  99.73 
 
 
370 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  99.46 
 
 
370 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  99.73 
 
 
370 aa  743    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  99.73 
 
 
370 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  100 
 
 
370 aa  745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  41.12 
 
 
370 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  45.34 
 
 
370 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  43.08 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  43.79 
 
 
380 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  43.2 
 
 
380 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  41.95 
 
 
369 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  42.41 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  42.41 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  42.41 
 
 
369 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  40.18 
 
 
369 aa  235  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  43.47 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  42.55 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  43.26 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  42.64 
 
 
340 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  41.72 
 
 
365 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  38.2 
 
 
372 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  41.67 
 
 
379 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  41.95 
 
 
367 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  40.71 
 
 
379 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  40.12 
 
 
366 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  43.25 
 
 
340 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  42.24 
 
 
344 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 
373 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.29 
 
 
371 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  42.25 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  42.25 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.81 
 
 
344 aa  219  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  42.33 
 
 
340 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  41.67 
 
 
308 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.34 
 
 
364 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 
316 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  36.81 
 
 
341 aa  205  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  40.06 
 
 
378 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  41.31 
 
 
343 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  35.89 
 
 
341 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  40.69 
 
 
345 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  35.28 
 
 
341 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.02 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 
314 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  44.7 
 
 
316 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  41.34 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.78 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  34.97 
 
 
379 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  42.8 
 
 
337 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  43.07 
 
 
386 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  41.67 
 
 
368 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  40.58 
 
 
307 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  34.71 
 
 
737 aa  193  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  39.62 
 
 
323 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 
345 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  40.58 
 
 
307 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  42.42 
 
 
316 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  35.9 
 
 
480 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  40.26 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  38.79 
 
 
315 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  43.38 
 
 
326 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  37.14 
 
 
306 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  36.93 
 
 
321 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  40.68 
 
 
308 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  37 
 
 
307 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  41.31 
 
 
311 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  38.71 
 
 
341 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  41.98 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  38.95 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  39.42 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  40.93 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  41.72 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  36.04 
 
 
807 aa  182  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  36.28 
 
 
308 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  31.7 
 
 
766 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.22 
 
 
322 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  40.23 
 
 
344 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  41.02 
 
 
309 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.32 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  40.86 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  39.38 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  40.31 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39.13 
 
 
340 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  43.23 
 
 
365 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  39.72 
 
 
334 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.15 
 
 
309 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  36.57 
 
 
313 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  35.69 
 
 
345 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  37.3 
 
 
309 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.03 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  39.87 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  36.98 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>