More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0378 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  87.36 
 
 		 379 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 365 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  86.54 
 
 		 379 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  66.94 
 
 		 366 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  59.07 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  56.44 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  58.24 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  55.22 
 
 		 369 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  55.49 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  55.22 
 
 		 369 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  55.31 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  55.22 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  56.87 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  56.25 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  54.95 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  55.22 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  56.21 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  54.79 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  55.07 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  54.79 
 
 		 369 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  54.14 
 
 		 340 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  54.44 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  54.14 
 
 		 340 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 379 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  44.07 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  36.34 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  41.64 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  41.72 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  41.72 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  41.72 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  41.72 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.72 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  38.18 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.89 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  43.71 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  43.71 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.2 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  36.42 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37 
 
 		 334 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  37.96 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  36.73 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.26 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  38.53 
 
 		 345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.1 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.36 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  42.14 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  37.05 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  39.56 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  38.63 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  31.58 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  34.81 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  34.27 
 
 		 737 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  36.21 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.07 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  37.42 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.67 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  37.73 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  37.6 
 
 		 807 aa  162  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  36.43 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  36.43 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.53 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  37.25 
 
 		 304 aa  159  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.49 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  35.14 
 
 		 766 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  39.63 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  34.55 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.55 
 
 		 306 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  35.48 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  37.59 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  31.67 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.63 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.73 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  38.83 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  34.9 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  31.43 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  37.94 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  50.24 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  36.92 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 		 348 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  37.55 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  35.16 
 
 		 316 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  31.43 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.54 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.28 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.28 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.59 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  43.58 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  36.3 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.32 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>