More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0085 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  100 
 
 
378 aa  766    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  55.41 
 
 
386 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  53.08 
 
 
372 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  44.05 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.94 
 
 
334 aa  225  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  40.18 
 
 
340 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.67 
 
 
336 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  37.73 
 
 
379 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  37.42 
 
 
379 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  38.18 
 
 
365 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.71 
 
 
344 aa  204  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  38.97 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40.92 
 
 
344 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  35.33 
 
 
369 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.55 
 
 
380 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.88 
 
 
380 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  35.13 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  33.54 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  33.83 
 
 
373 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.47 
 
 
371 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  37.16 
 
 
331 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  37.13 
 
 
370 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 
379 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  41.73 
 
 
328 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  40.18 
 
 
370 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  40.18 
 
 
350 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  40.18 
 
 
370 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.18 
 
 
370 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  40.18 
 
 
370 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  40.18 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  40.18 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.97 
 
 
306 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  38.11 
 
 
322 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  42.37 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  34.04 
 
 
351 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  38.72 
 
 
359 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.45 
 
 
364 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  30.66 
 
 
322 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  38.81 
 
 
341 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.06 
 
 
343 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 
345 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  36.75 
 
 
352 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.29 
 
 
316 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  34.07 
 
 
369 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  32.73 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  34.76 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  36.31 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  34.68 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  38.21 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  32.97 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  32.97 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  34.88 
 
 
306 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  37.75 
 
 
309 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.49 
 
 
311 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  42.69 
 
 
342 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  34.73 
 
 
337 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  32.5 
 
 
304 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  34.8 
 
 
373 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 
309 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  36.46 
 
 
330 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  34.65 
 
 
306 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  34.86 
 
 
316 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 
309 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  34.47 
 
 
308 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  35.98 
 
 
347 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.64 
 
 
309 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 
325 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  35.42 
 
 
326 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  34.9 
 
 
345 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.11 
 
 
309 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 
316 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  36.54 
 
 
311 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 
323 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  30.7 
 
 
369 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  29.55 
 
 
737 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  33.81 
 
 
340 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  30.68 
 
 
480 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  33.81 
 
 
340 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 
368 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  32.11 
 
 
341 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  35.56 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  35.56 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  31.23 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 
309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  33.04 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  35.69 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  34.05 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 
309 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  33.43 
 
 
309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  29.01 
 
 
807 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.7 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  33.84 
 
 
341 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  30.41 
 
 
367 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  31.49 
 
 
341 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>