More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0801 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  98.15 
 
 		 379 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  87.36 
 
 		 365 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 		 379 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  65.57 
 
 		 366 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  59.03 
 
 		 380 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  59.03 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  57.92 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  55.74 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  56.83 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  56.28 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  56.28 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  56.28 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  57.57 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  54.74 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  55.34 
 
 		 369 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  53.59 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  55.34 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  55.62 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  55.34 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  55.46 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  54.28 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  54.57 
 
 		 340 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  54.57 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  42.73 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  41.59 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  41.67 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.67 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  41.67 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  41.67 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  41.67 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  37.42 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  35.99 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  43.38 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  43.38 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.2 
 
 		 344 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.7 
 
 		 334 aa  189  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.36 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  35.57 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  34.56 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.47 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  34.57 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  36.42 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  35.23 
 
 		 341 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  37.28 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.71 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.25 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  35.28 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  36.83 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  39.16 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.12 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.97 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  38.71 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  36.84 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  42.21 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  33.13 
 
 		 807 aa  166  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.27 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  31.8 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  38.21 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  38.21 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  38.71 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  37.42 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  34.78 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  34.78 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  36.77 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  37.68 
 
 		 311 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  37.1 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.26 
 
 		 307 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  34.86 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  38.64 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.94 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  37.77 
 
 		 309 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  34.56 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  32.4 
 
 		 737 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  35.99 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  35.71 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  35.96 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.46 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.01 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  42.2 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  35.17 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  36.69 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  35.55 
 
 		 304 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  32.08 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 341 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  49.74 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  34.41 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>