More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2777 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  100 
 
 		 368 aa  715    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  41.36 
 
 		 370 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.18 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.89 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.88 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  42.56 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  42.56 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.56 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  42.56 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  42.56 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  41.87 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  40.59 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  42.26 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  44.09 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  44.09 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  40.59 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  40.69 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  37.41 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  38.28 
 
 		 379 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  41.72 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  38.31 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.48 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  35.42 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  45.26 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  40.84 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  40.84 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  43.15 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  41.1 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.99 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  41.42 
 
 		 345 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  34.55 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  34.18 
 
 		 341 aa  166  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  34.91 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  36.88 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  36.88 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  40.19 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  40.19 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  40.84 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  40.19 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.27 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.08 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.4 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  33.1 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  37.82 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  38.93 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  44.73 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  36.6 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  37.32 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.29 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  39.46 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.26 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.4 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  29.05 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  43.88 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.64 
 
 		 308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  38.55 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  43.96 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  40.14 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.71 
 
 		 337 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  43.68 
 
 		 309 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.62 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  39.23 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  41.73 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  43.15 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.23 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  33.97 
 
 		 451 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  31.75 
 
 		 737 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.4 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 		 308 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  41.33 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  39.76 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.2 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  35.77 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  36.4 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.29 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  35.02 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  39.76 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  36.16 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  34.81 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  30.79 
 
 		 766 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  37.02 
 
 		 393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  34.04 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  42.41 
 
 		 325 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  35.02 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>