More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6515 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 354 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.64 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.92 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.35 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  35.55 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.89 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  35.38 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.32 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 365 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  37.23 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  36.62 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  33.97 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  40.33 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  40.33 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  40 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  40.89 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  38.16 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  36.19 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  36.51 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  36.51 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  36.19 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  39.74 
 
 		 340 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.66 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  39.74 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  39.74 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  39.39 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  39.18 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  35.05 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  37.17 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  34.11 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  41.52 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  34.69 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  37.17 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.55 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  37.17 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  37.17 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  37.17 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.17 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  33.04 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  42.17 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  36.16 
 
 		 309 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  38.36 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  32.74 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  38.34 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  38.64 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  33.63 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.98 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  38.64 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.94 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  30.47 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  34.05 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  34.63 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.18 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  34.57 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  32.03 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  34.75 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  39.15 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  41.86 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  33.09 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  34.9 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  31.25 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  38.36 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  35.36 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  41.26 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  37.66 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  37.92 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  41.4 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  36.46 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  32.06 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  35.37 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  37.34 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  45.55 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  34.07 
 
 		 316 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  34.81 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  36.58 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  43.97 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  34.74 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  35.43 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  30.71 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  36.3 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  40.32 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  33.79 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  32.73 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  31.91 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.16 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.89 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  35.69 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  36.47 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>