More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3527 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 		 344 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  97.38 
 
 		 344 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  91.28 
 
 		 344 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  52.94 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  52.35 
 
 		 344 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  53.35 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  53.06 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  50.59 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  50.88 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  50.88 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  50.44 
 
 		 342 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  49.12 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  52.02 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  54.52 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  54.57 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  49.41 
 
 		 341 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  49.42 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  50 
 
 		 341 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  50.43 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  54.07 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  54.36 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  53.3 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  51.59 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  50 
 
 		 341 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  51.01 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  50.72 
 
 		 353 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  49.57 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  48.13 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  47.88 
 
 		 354 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  48.99 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  45.53 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  43.44 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  45.71 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  42.4 
 
 		 342 aa  255  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  42.99 
 
 		 578 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.19 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  40.7 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  42.23 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 		 577 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  41.01 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  41.71 
 
 		 340 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  40.17 
 
 		 357 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  44 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  41.71 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  41.71 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  44 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  44 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  41.28 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  41.71 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  43.43 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  43.43 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  43.43 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  39.66 
 
 		 582 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  43.14 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.55 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  41.55 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.26 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.26 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.26 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.26 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  40.97 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  39.54 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  40.63 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  37.68 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  42.04 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  37.16 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  39.29 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  40.35 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.3 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.83 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  39.51 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  37.82 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.88 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  37.22 
 
 		 364 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  31.1 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  35.85 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.45 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  47.42 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.75 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  31.87 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  36.2 
 
 		 309 aa  133  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  32.36 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.83 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  34.84 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  36.33 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  37.71 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  37.55 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  38.49 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.96 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>