More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3171 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  97.38 
 
 		 344 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 344 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  91.28 
 
 		 344 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  53.53 
 
 		 344 aa  361  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  53.64 
 
 		 346 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  52.65 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  53.35 
 
 		 346 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  51.47 
 
 		 347 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  50.88 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  51.18 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  50 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  50.59 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  51.03 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  55.1 
 
 		 345 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  52.6 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  54.57 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  50.29 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  54.65 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  51.01 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  54.94 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  53.3 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  51.59 
 
 		 345 aa  315  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  50.29 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  51.3 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  51.3 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  50.43 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  49.86 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  47.84 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  47.88 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  46.22 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  45.22 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  46.35 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  42.98 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  43.44 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  42.99 
 
 		 578 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  44.77 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.48 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 		 577 aa  245  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 342 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  40.7 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  40.17 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  44 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  44 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  44 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  41.14 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  41.14 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  40.45 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 340 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  43.43 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  43.43 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  40.86 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  43.43 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  41 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  39.37 
 
 		 582 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  43.14 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  41.83 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.83 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.55 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.55 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.55 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.55 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  41.26 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  39.83 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  38.24 
 
 		 368 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  40.92 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  37.32 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  42.04 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.9 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  37.16 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  44.16 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  40.43 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  38.89 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.72 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.77 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  37.82 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.92 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.74 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  35.85 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.79 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  46.91 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  31.87 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  32.36 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.75 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  33.71 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  36.2 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  35.5 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  34.43 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  38.91 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.34 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.57 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>