More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0475 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 343 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  58.36 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  57.77 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  55.13 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  56.6 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  55.72 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  54.55 
 
 		 342 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  54.84 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  54.55 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  54.39 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  54.09 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  52.49 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  53.37 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  53.53 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  52.77 
 
 		 345 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  51.31 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  49.12 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  51.9 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  49.12 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  46.51 
 
 		 342 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  44.57 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  48.71 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  47.97 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  43.7 
 
 		 341 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  47.69 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  47.4 
 
 		 345 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  45.38 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  44.7 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  45.27 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  42.57 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  42.11 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  39.88 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  41.4 
 
 		 341 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  42.98 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  41.52 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  38.26 
 
 		 340 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  38.26 
 
 		 340 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  38.42 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  37.68 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.54 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  38.48 
 
 		 342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  37.68 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  39.42 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  38.58 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  36.62 
 
 		 582 aa  228  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  36.13 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  38.12 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  37.1 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  39.02 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.02 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  38.15 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  35.87 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  37.58 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.86 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.86 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.86 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.86 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  37.86 
 
 		 340 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  36.69 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  39.51 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  36.52 
 
 		 341 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  36.52 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  36.52 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  36.59 
 
 		 325 aa  206  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  36.52 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  36.52 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  37.13 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  35.23 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  36.83 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  35.94 
 
 		 340 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  35.94 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  42.08 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  33.13 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  32.42 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  34.12 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  39.19 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36.8 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.73 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.94 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  33.48 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  32.01 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  36.65 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  38.12 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  39.7 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  35.5 
 
 		 435 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  35.47 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.25 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0860  histone deacetylase superfamily protein  36.32 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.42 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  34.93 
 
 		 438 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  33.21 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  34.21 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>