More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2856 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
342 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  62.57 
 
 
342 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  58.11 
 
 
341 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  57.65 
 
 
341 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  56.14 
 
 
342 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  55.56 
 
 
342 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  57.52 
 
 
341 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  57.69 
 
 
346 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  45.86 
 
 
337 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  50.15 
 
 
340 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  48.96 
 
 
341 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  46.59 
 
 
357 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  47.34 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  47.63 
 
 
340 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  46.75 
 
 
340 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  46.75 
 
 
340 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  46.45 
 
 
340 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  47.34 
 
 
340 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  49.27 
 
 
341 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  49.27 
 
 
341 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  49.11 
 
 
340 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  44.81 
 
 
368 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.94 
 
 
340 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  49.27 
 
 
341 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  47.94 
 
 
340 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  48.68 
 
 
340 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  48.68 
 
 
340 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  49.7 
 
 
341 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  49.71 
 
 
353 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  49.26 
 
 
340 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.65 
 
 
340 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.65 
 
 
340 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.65 
 
 
340 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.65 
 
 
340 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  47.35 
 
 
340 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  47.35 
 
 
340 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  48.96 
 
 
340 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  44.67 
 
 
346 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  44.67 
 
 
346 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  46.73 
 
 
346 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  45.75 
 
 
340 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  43.24 
 
 
361 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  46.45 
 
 
346 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  45.71 
 
 
344 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  44.28 
 
 
342 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  41.74 
 
 
344 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  41.45 
 
 
344 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  42.11 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  46.35 
 
 
344 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  41.23 
 
 
342 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  40.64 
 
 
347 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  44.23 
 
 
354 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  40.35 
 
 
347 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  40.23 
 
 
341 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  41.28 
 
 
343 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  43.82 
 
 
343 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  41.26 
 
 
359 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  43.6 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  43.31 
 
 
358 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 
347 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  42.07 
 
 
345 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  39.77 
 
 
347 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  45.08 
 
 
344 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 
356 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  38.48 
 
 
343 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  40.76 
 
 
341 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 
345 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  44.24 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 
577 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  42.94 
 
 
353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  40.32 
 
 
578 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  40 
 
 
582 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.37 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  32.04 
 
 
315 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  33.95 
 
 
407 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  40.24 
 
 
369 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.97 
 
 
344 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.42 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  42.29 
 
 
379 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  41.9 
 
 
379 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  33.74 
 
 
334 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.42 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.37 
 
 
371 aa  146  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 
365 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  36.94 
 
 
345 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.86 
 
 
380 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 
335 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  40.4 
 
 
438 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 
369 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.8 
 
 
380 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  37.1 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  42.01 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  40.93 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  42.01 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.05 
 
 
331 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.75 
 
 
336 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  43.41 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  39.29 
 
 
373 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  32.83 
 
 
807 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>