More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1226 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 340 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  96.76 
 
 		 340 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  99.12 
 
 		 340 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  94.71 
 
 		 340 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  99.12 
 
 		 340 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  95.29 
 
 		 340 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  92.94 
 
 		 340 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  79.41 
 
 		 341 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  79.12 
 
 		 341 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  78.82 
 
 		 341 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  78.53 
 
 		 340 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  78.53 
 
 		 340 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  78.24 
 
 		 340 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  77.94 
 
 		 340 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  69.41 
 
 		 340 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  69.37 
 
 		 341 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  70.88 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  70.88 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  70.88 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  70.88 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  65.29 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  70.88 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  73.67 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  70.59 
 
 		 340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  62.5 
 
 		 337 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  47.44 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  46.45 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  46.92 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  49.43 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  45.43 
 
 		 342 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  45.77 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 347 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  43.77 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  43.48 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  44.09 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  42.61 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  41.74 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.38 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  43.44 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  43.77 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  42.86 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  41.45 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  43.52 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  40.29 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  40.87 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  37.68 
 
 		 343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  41.71 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  41.03 
 
 		 343 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  45.09 
 
 		 343 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  42.45 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  43.44 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  43.15 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  42.05 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  39.72 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  38.44 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  41.67 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  41.62 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 578 aa  209  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  41.07 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  40.36 
 
 		 582 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  39.02 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  43.15 
 
 		 577 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  30.56 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  37.93 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  40.17 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  41.74 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  38.5 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.94 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  38.81 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.4 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  42.13 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  37.45 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 364 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36.75 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.43 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  30.84 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.72 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  41.31 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  42.78 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.99 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.47 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  33.95 
 
 		 438 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  34.29 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  37.56 
 
 		 370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  40.47 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.77 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  31.93 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>