More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3254 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 345 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  96.81 
 
 		 345 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  90.43 
 
 		 345 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  70.76 
 
 		 343 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  61.92 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  61.05 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  59.83 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  59.25 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  58.6 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  57.43 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  57.43 
 
 		 347 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  55.52 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  57.14 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  56.56 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  51.31 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  51.73 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  54.07 
 
 		 344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  56.1 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  52.92 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  54.65 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  54.73 
 
 		 353 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  50.15 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  53.03 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  50.86 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  52.74 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  48.69 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  50.46 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  48.99 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  47.09 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  46.51 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  47.97 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  46.99 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  46.36 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  46.42 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  45.87 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  44.09 
 
 		 342 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  42.94 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  39 
 
 		 577 aa  233  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  38.19 
 
 		 582 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  38.95 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 		 578 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  41.62 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  41.36 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.36 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  42.36 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  39.71 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  42.07 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  39.38 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  38.22 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.79 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.79 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.79 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.79 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  40.35 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  34.44 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  35.36 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  41.62 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  40.46 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  40.46 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  41.45 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  41.16 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  44.85 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  39.88 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  43.48 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  42.54 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.75 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  39.38 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.35 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  42.04 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  43.78 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  41.01 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  39.45 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  36.11 
 
 		 322 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  38.01 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  38.77 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  34.78 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.95 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  38.81 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  37.74 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  39.32 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  32.38 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.3 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.22 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3438  histone deacetylase superfamily protein  40.25 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0165681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.12 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>