More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2062 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  92.94 
 
 
340 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  92.65 
 
 
340 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
340 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  94.12 
 
 
340 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  93.24 
 
 
340 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  93.24 
 
 
340 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  93.53 
 
 
340 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  80 
 
 
341 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  80.29 
 
 
341 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  80.59 
 
 
341 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  80.59 
 
 
340 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  80.59 
 
 
340 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  80.29 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  80 
 
 
340 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  69.55 
 
 
340 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  72.65 
 
 
340 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.65 
 
 
340 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.35 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.35 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  68.47 
 
 
341 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  75.44 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  72.06 
 
 
340 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.35 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.35 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  72.06 
 
 
340 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  64.88 
 
 
337 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  65.88 
 
 
368 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  49.11 
 
 
342 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  49.12 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  47.44 
 
 
357 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  49.72 
 
 
353 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  47.2 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  45.91 
 
 
342 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  46.4 
 
 
341 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  44.13 
 
 
347 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  44.41 
 
 
347 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  44.13 
 
 
347 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  44.13 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  43.39 
 
 
342 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  43.48 
 
 
341 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  45.24 
 
 
341 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  45.82 
 
 
341 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  45.22 
 
 
342 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  44.25 
 
 
346 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  43.68 
 
 
346 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  43.48 
 
 
344 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  42.32 
 
 
344 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  44.96 
 
 
346 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  39.42 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  41.74 
 
 
361 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  42 
 
 
344 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  44.83 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  40.74 
 
 
343 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  47.89 
 
 
341 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  41.88 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  43.44 
 
 
345 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  43.44 
 
 
358 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  42 
 
 
344 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 
344 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  41.98 
 
 
356 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 
345 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  40.28 
 
 
354 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 
341 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  43.15 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  42.56 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  41.62 
 
 
345 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 
345 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 
578 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  39.82 
 
 
582 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  39.31 
 
 
341 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 
577 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.48 
 
 
325 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  30.77 
 
 
315 aa  188  9e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  37.07 
 
 
353 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.2 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.13 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  40.87 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.94 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39.73 
 
 
340 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  42.21 
 
 
322 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  44.95 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  37.12 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.55 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.91 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  41.31 
 
 
369 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  39.77 
 
 
385 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  41.35 
 
 
322 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  44.33 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  37.62 
 
 
438 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  37.44 
 
 
385 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  41.2 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  31.12 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.25 
 
 
380 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  41.2 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.99 
 
 
371 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.01 
 
 
380 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.39 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  41.27 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>